Come pluign è molto valido ma preferisco qualcosa di più snello, vedo se trovo alternative altrimenti uso quello.

Ok tienici informati.

Ho deciso di installare il plugin, non ho trovato alternative valide, ora il mio dubbio è il meta tag keywords e description che ho creato io nel tema di wordpress li lascio o li tolgo? (Visto che già vengono gestiti dal plugin)

Se vengono modificati allora è indifferente credo.
Mentre se c'è un doppione meglio toglierlo.

Io ho controllato il sorgente della pagina con firefox e vedo sia il meta tag di default del tema che quello creato dal plugin però se provo a fare una scansione con dei tools tipo tuttowebmaster mi controlla solo quello del plugin, per questo mi era venuto un dubbio, non vorrei che google lo vedesse doppio.
A 'sto punto penso anch'io sia meglio toglierlo e poi vedere come si comportano i motori di ricerca.

A mio parere con una gestione doppia di tag rischi di modificare anche le percentuali delle keywords, ma non so se questa regola sia seguita anche in caso di tag doppi.
Google "leggendo" il testo del sito, e trovando questo testo due volte credo potrebbe reagire negativamente.
Magari attendiamo altri consigli da altri utenti.

Per non andare troppo off-topic dici che sia meglio postare la domanda in "Posizionamento nei motori di ricerca" qui sul forum?

Concordo.
Qui continuiamo con consigli generali su grafica e altro.

Guardacaso c'era già una discussione aperta proprio su questo argomento :D, ho avuto la mia risposta sul meta tag descritpion e deduco che sia cosi anche per le keyword comunque mi sono aggiunto alla discussione e ho fatto lo stesso la domanda.

Eh eh spesso basta solo cercare e si trova la domanda.