@Federico Sasso said:

Ciao elettrofranky,

A mio avviso NON devi fare rimozione degli URL, ma farne - e al più presto - un redirect 301 verso il nuovo formato.
In sé i numerosi 404 non sarebbero un problema, sparirebbero da soli dopo un po' dall'indice di Google, e poi dalla lista segnalata da GWT, ma ti conviene invece impostare i redirect 301 così da non perdere tutta la "equity" associata ai vecchi URL e trasferirla verso i nuovi.

Spero d'esserti stato utile

Grazie mille Federico,
vedrò di andare tramite .htaccess inserendo i 404 e facendo il redirect su link aggiornato.
Grazie,

Francesco