Di solito insieme a questa impostazione si mettono anche:
search engine friendly urls > Yes
use url rewriting > Yes

In questo modo l'URL dominio.com/pagina diviene dominio.com/pagina.html .

Suffisso URL, rel canonical e contenuti duplicati
Uno svantaggio dell'uso del suffisso secondo me è dovuto alla creazione di contenuti duplicati, cioè di più URL che presentano gli stessi dati. In caso di attivazione del suffisso url, infatti, i due URL sopra sono entrambi attivi.

A differenza di Joomla 2.5, la release 3.x gestisce anche il rel canonical. Con il suffisso URL attivato in Joomla 3, la pagina dominio.com/pagina presenta il link rel canonical verso pagina.com/pagina.html . Leggi anche qui: http://www.giorgiotave.it/forum/joomla/221062-joomla-3-3-adds-suffix-url-problemi-con-rel-canonical-e-contenuti-duplicati.html

Fin qui si è parlato del suffisso html. Si può però aggiungere anche un suffisso diverso come htm o php.

Come aggiungere il suffisso URL php o htm a Joomla 2.5
Il file responsabile di questa funzionalità di Joomla è il router.php che si trova in questo percorso: root di Joomla 2.5/includes/router.php

Per aggiungere il suffisso php all'url procediamo come segue:

• impostiamo su Yes le 3 voci sopra e in particolare adds suffix to url.
• archiviamo una copia del file router.php, quindi modifichiamo il file come segue:

Al posto della riga 67:

$vars['format'] = $suffix;

inseriamo questo (sostituzione):

// $vars['format'] = $suffix; questa riga va eliminata e sostituita con le seguenti
$path = str_replace('.'.$suffix,'' , $path);
if ($suffix == 'php') {
    $path = str_replace('.'.$suffix,'' , $path);
    $vars['format'] = 'html';
} else {
    $path = str_replace('.'.$suffix,'' , $path);
    $vars['format'] = $suffix;
}

Al posto della riga 92:

if ($format = $uri->getVar('format', 'html')) {

inseriamo questo (sostituzione):

if ($format = $uri->getVar('format', 'php')) { // basta sostituire html con php

Ottenere gli URL con suffisso .htm su Joomla 2.5
La procedura è identica a quella vista per il suffisso php, con l'unica differenza di "htm" al posto di "php" (una sostituzione nel primo blocco di codice e una nel secondo).

Cambiare suffisso url in Joomla 3
Concettualmente la procedura è quella già vista per Joomla 2.5, ma a cambiare sono il nome del file e il suo percorso.
Identica procedura, quindi, ma a questo percorso: *root di Joomla 3>libraries>cms>router>site.php *.

Anche il codice da sostituire è identico, ma in questo caso si trova rispettivamente alle righe 82 e 118.

Note
Nonostante abbia indicato la procedura (richiesta anche qui: http://www.giorgiotave.it/forum/joomla/220323-scrivere-gli-url-come-nella-versione-del-sito-senza-joomla-3.html) sono contrario ad applicarla per diversi motivi:

• il sistema di routing di Joomla e il componente SEO/SEF non risolvono il problema dei contenuti duplicati, in quanto con il suffisso URL attivo le pagine sono raggiungibili anche dall'URL senza suffisso;
• Joomla 2.5 di base non imposta il rel canonical;
• quando si attiva un suffisso URL tra htm e php, sono raggiungibili anche le pagine agli URL con suffisso html (ancora contenuti duplicati);
• modificare i file del core è sbagliato, in quanto al successivo aggiornamento si perdono le modifiche effettuate.

A mio parere l'unica maniera per risolvere tutti i problemi di cui sopra (e alcuni altri collaterali, sempre in ambito SEO/SEF) è un plugin, che è la maniera corretta per fare l'override.